n伏筆和真相
- 波尼恰爾一開始提到的「像你一樣使用不可思議力量的女人」指的是阿舒蕾，她利用時間跳躍之力到未來的東京和機械軍團戰鬥。
- 提達一開始對玩家感到眼熟是因為在2095年就已經先見過面了，當然這可能牽扯到一些時空悖論的問題，總之不要想太多比較好。
- 瑪魯大喊「別過來！」能夠讓機械軍團停下攻擊是因為她是普雷茲首腦愛著的對象。
- 阿夕亞在第三次時空穿梭之前就有想到是不是杜那斯做的，但沒有百分之百確定。
- 提達的身世和人物關係與普雷茲首腦密不可分，也因此他才會走向駕駛員的道路。
- 普雷茲首腦完全沒有任何攻擊動作是因為杜那斯故意讓玩家擊敗來產生歷史補正。
- AI叛變的原因是由普雷茲首腦因先對瑪魯產生的感情，而後調查瑪魯昏迷不醒的原因正是人類科技進步造成的環境汙染，才會下達破壞東京的決定。
n伏筆(?)
- 最初日本守護者三人組的能力是模仿黑魔法師（或者說白魔法師？）學習而來的這個設定似乎還在，但是沒有明講，而如果在第二章最後選擇睜不開眼的話，玩家會說「守護者有三個人和我所在的世界一樣……」意味深長的話，不知道是不是楓之谷M專屬的伏筆。
n和舊版不同的部分
- 原先提達的登場從2102年的澀谷（東京上空那個只是給勳章沒劇情不算的話），新版改為在臺場就出現，這點對劇情理解和感情移入帶來了不少幫助，也給主角加了很多內心戲。
- 杜那斯的登場由秋葉原改為東京上空擊敗尼貝龍根之後，這點我猜是為了方便敘述劇情，舊版關於守護者三人組的說明是在秋葉原結束後講一半，突然被趕去東京上空打完尼貝龍根回來才講第二段。
- 舊版在第二季（對應新版最終章部分）有三條分支結局，新版則以真結局為基礎並簡化設定補充的環節（原本要各年代繞才能得知真相，新版則是提達直接講）。
- 無名魔獸的戲份被整個砍掉，因為舊版真結局劇情到最後杜那斯還是逃離魔獸體內的關係，可能是為了加快劇情節奏就乾脆刪掉了。
- 新版對於杜那斯的轉生能力設定依舊存在，但對其使用的描寫進行了刪除，所以新版沒有細講他是如何進入瑪魯體內的。
- 舊版杜那斯因為只有怪物模組，沒有NPC模組，因此幾乎沒有臺詞，新版幫他加了不少臺詞來補足這個反派的內心戲，並且角色塑造可以說是相當立體。
n一些細節
- 瑪莉夏茲上尉表示自己穿女僕裝是有理由的，但這個理由究竟是什麼最後仍未解釋，我個人的猜測是司令室那個叫諾蘭的人喜好的原因。
- 舊版未來東京中諾蘭曾經操控伊魯薇達指揮官零件下達自爆命令，並且可以為玩家製作星之劍、焰之劍材料和魔．手裡劍，估計應該是日本防衛軍的技術部門之類的存在。
- 加魯達司令無論是在舊版還是新版都一眼看穿了玩家的真實身分，原因不明。
- 伊魯薇達是人類方設計的機器人，原先作為殺手鐧存在，但被機械軍團奪走後才變成敵人。
- 決戰兵器的外型設計和提達的人物設計似乎是有稍微致敬鋼彈系列和阿姆羅……的樣子，但決戰兵器從頭到尾的鏡頭都只有被打趴下去的那個畫面。
- 奧芙赫班究竟是什麼存在最後仍未詳細說明，可能只是單純作為推動劇情的一個危機這樣的要素。
- 阿卡夏．編年史為何存在，為何日本的命運會被這本書給掌控並沒有進行說明，但這個設定和本傳的世界的意志操控命運等設定有異曲同工之妙。
- 未來東京有不少小怪都有多種攻擊模式以及專屬登場動畫，可是說是做得非常用心。
- 杜那斯額頭上那根角怎麼來的並沒有解釋，不過可能也跟劇情無關？
- 瑪魯現在有長生不老之力……也就是說無論到幾歲都是個少女(?)
- 楓之谷M專門為了阿夕亞和瑪魯畫了新的人物點陣圖，以及新增數張插圖還有一首BGM
達人
