這是五十年後的未來,世界被「神」吞食殆盡而荒廢的故事。
北歐地域發現了和到現在為止完全不一樣的細胞【オラクル】,之後オラクル爆炸性的增殖,把地球上有的對象都「捕食」之後,用非常急激的速度進化。這種兇暴的生命體有了多樣性和分化,都市文明被牠們在短期間毀壞。在這種オラクル細胞集合體的威脅下,人們稱呼牠們為【荒神】,意即「狂暴的神靈」。
既有的兵器對荒神完全沒有任何用處;既有的軍隊和政府都無力化,於是殘存下來的人類開始等待世界末日的來臨。這時,人類在世界完全崩毀之前得到了【可以吞食神的東西】。放入了オラクル細胞的生體兵器【神機】被生化科學企業【芬里爾】(フェンリル)開發出來,並同時編成了在自己的身體裡接種オラクル細胞,來和神機連結並使用的特殊部隊【噬神者】。